Akreditasi Universitas Cenderawasih atau UNCEN sesuai keputusan BAN-PT pada tahun 2015 bahwa Universitas tersebut telah terakreditasi B dan berlaku sampai tahun 2020. Universitas Cendrawasih atau UNCEN yaitu perguruan tinggi paling tua di tanah Papua. Perjalanan bermula saat adanya keterlibatan gereja Protestan tahun 1856 dan gereja Katolik pada tahun 1921 memberikan kontribusi secara signifikan pada sektor pendidikan di Papua. Selain mendirikan Sekolah Desa, Sekolah Sambung, Sekolah Teknik Rendah, Sekolah Kerumahtangga, Sekolah Guru, dan Sekolah Tingkat Menengah di Jayapura.

Irian Barat pada saat itu secara administrasi masih berada dalam naungan Pemerintahan United Nations for Temporary Authority atau UNTEA, sebuah pemerintahan di bawah yuridiksi Sekjen PBB dan secara administratif Papua atau Irian Barat saat itu belum resmi masuk dalam Republik Indonesia.

Tahun 1963, Indonesia akhirnya resmi memperoleh Papua atau Irian Barat, sehingga UNCEN akhirnya menjadi satu-satunya lembaga pemerintahhan Republik Indonesia yang berdiri di Irian Barat, menjadi perwakilan Republik Indonesia. Ada beberapa pilihan fakultas yang tersedia di Universitas Cenderawasih sebagaimana berikut:

• Fakultas Keguruan Dan Ilmu Pendidikan
• Fakultas Ilmu Sosial Dan Ilmu Politik
• Fakultas Hukum
• Fakultas Ekonomi Dan Bisnis
• Fakultas Matematika Dan Ilmu Pengetahuan Alam
• Fakultas Teknik
• Fakultas Kesehatan Masyarakat
• Fakultas Ilmu Keolahragaan
• Pascasarjana

Jurusan dan Akreditasi UNCEN (S1)

Peringkat akreditasi program studi program pendidikan yang ada di Universitas Cenderawasih sesuai penilaian dari Badan Akreditasi Nasional perguruan tinggi atau BAN-PT yaitu:

1. Jurusan pendidikan bahasa dan sastra Indonesia (S1) -  akreditasi B berlaku 2019-2024
2. Jurusan ilmu kesehatan masyarakat (S1) - akreditasi B berlaku 2019-2024
3. Jurusan Manajemen Pendidikan (S1) - akreditasi C berlaku 2019-2024
4. Jurusan ilmu kelautan (S1) - akreditasi B berlaku 2019-2024
5. Jurusan Planologi (S1) - akreditasi C berlaku tahun 2019-2024
6. Jurusan pendidikan jasmani, kesehatan dan rekreasi (S1) - akreditasi B berlaku tahun 2019-2024
7. Jurusan pendidikan Pancasila dan Kewarganegaraan (S1) - akreditasi B berlaku tahun 2018-2023
8. Jurusan pendidikan (S1) - akreditasi B berlaku 2018-2023
9. Jurusan Manajemen (S1) - akreditasi B berlaku 2018-2023
10. Jurusan Ilmu Keolahragaan (S1) - akreditasi B berlaku 2018-2023
11. Jurusan pendidikan kimia (S1) - akreditasi B berlaku 2018-2023
12. Jurusan farmasi (S1) - akreditasi B berlaku 2018-2023
13. Jurusan Teknik Mesin (S1) - akreditasi B berlaku 2018-2023
14. Jurusan Teknik Pertambangan (S1) -akreditasi B berlaku 2018-2023
15. Jurusan pendidikan bahasa Inggris (S1) - akreditasi B berlaku 2018-2023
16. Jurusan Teknik Elektro (S1) - akreditasi B berlaku 2018-2023
17. Jurusan pendidikan geografi (S1) - akreditasi B berlaku 2017-2023
18. Jurusan Kedokteran (S1) - akreditasi B berlaku 2017-2022
19. Jurusan ekonomi pembangunan (S1) – akreditasi B berlaku 2017-2022
20. Jurusan ilmu hukum (S1) - akreditasi B berlaku 2017-2022

 Jurusan dan Akreditasi UNCEN (S2) dan Profesi

1. Jurusan Manajemen (S2) - akreditasi B berlaku 2019-2024
2. Jurusan ilmu kesehatan masyarakat (S2) - akreditasi B berlaku 2019-2024
3. Jurusan pendidikan IPA (S2) - akreditasi B berlaku dari 2018-2022
4. Jurusan ilmu administrasi publik (S2) - akreditasi B berlaku tahun 2017-2022
5. Jurusan sosiologi (S2) - akreditasi B berlaku tahun 2017-2022
6. Jurusan pengelolaan sumber daya alam dan lingkungan (S2) - akreditasi B tahun 2017-2022
7. Jurusan ilmu ekonomi (S2) -  akreditasi B tahun 2017-2022
8. Jurusan pendidikan matematika (S2) - akreditasi C berlaku tahun 2017-2021
9. Jurusan dokter profesi - akreditasi B berlaku tahun 2017-2022

Untuk jurusan lainnya, akreditasi Universitas Cenderawasih belum memberikan update atau masih dalam informasi kadaluwarsa. Itulah penjelasan lengkap tentang akreditasi dan program jurusan di UNCEN, semoga bermanfaat!